LabImage 1D ist eine von Kapelan Bio-Imaging entwickelte Software-Lösung für die Quantifizierung von 1D Gelen und Western Blots. Dabei wird nicht nur größtes Augenmerk auf eine hochqualitative Bildanalyse und ein umfangreiches Reporting gelegt, auch die Automatisierung sich wiederholender Prozesse ist eine wichtige Kernfunktion von LabImage 1D. Sie erlaubt zum einen eine Beschleunigung des gesamten Auswertprozesses, zum anderen wird sichergestellt, dass identische Parameter und vergleichbare Kriterien verwendet werden, um eine Reihe von Messdaten zu analysieren. Dies ist besonders dann sinnvoll, wenn unterschiedliche Personen an der Auswertung der Daten beteiligt sind. Die Definition festgelegter und automatisch durchgeführter Arbeitsschritte ist flexibel und intuitiv. Hierfür hat LabImage 1D viele Funktionen, die an die spezifischen Ansprüche des jeweiligen Nutzers individuell angepasst werden können.
Nachdem ein Projekt gestartet wurde, können einzelne automatisierte Prozesse manuell ausgewählt und angepasst werden. In diesem Workflow wird der Nutzer Schritt für Schritt durch den Prozess geleitet. Dabei sind die einzelnen Funktionen logisch angeordnet, sodass sie sich auch ohne eine aufwendige Einarbeitung in die Software intuitiv bedienen lassen. Hier finden sich grundlegende Prozessschritte zur Vorbereitung der auszuwertenden Bilddatei wie Drehung, Spiegelung oder Inversion. Im nächsten Schritt geht es um die exakte Festlegung der zu analysierenden Bildausschnitte. So können Banden oder Spuren manuell oder automatisch erfasst und nach Bedarf angepasst werden. Außerdem ermöglichen nur wenige Klicks eine Reduktion des Bildhintergrundes. Nachdem nun alle Regionen definiert wurden, erfolgt die quantitative Analyse der ausgewählten Bildausschnitte (ROI). Hier können zum Beispiel die Banden automatisch auf den jeweilig verwendeten Marker bezogen werden, sodass die Größe der detektierten Probe direkt angezeigt wird. Die Software analysiert dabei die Graustufen der gewählten Spur oder Bande und zeigt genau auf, an welchen Positionen Ausschläge welcher Stärke detektiert werden können. Der Nutzer erhält somit eine detaillierte Analyse und kann gleichzeitig jeden einzelnen Schritt prüfen und gegebenenfalls anpassen, bevor das endgültige Analyseergebnis gespeichert wird. Dadurch behält er die volle Kontrolle über die Auswertung, was allerdings mühsam und langwierig werden kann, wenn viele ähnliche Bilddateien analysiert werden müssen.
Workflow Anpassungen
Für diesen Fall bieten Makros die perfekte Lösung, denn sie ermöglichen eine schnelle und vollautomatische Auswertung. Ein Makro beschreibt den automatisierten Ablauf vorher definierter Arbeitsschritte. So können sämtliche Funktionen aus dem Workflow in einer beliebigen Reihenfolge individuell kombiniert und als Ablaufprotokoll hinterlegt werden. Bei der Anwendung dieses Protokolls an einer Bilddatei werden alle Arbeitsschritte automatisch durchgeführt und das Ergebnis präsentiert. Eine mühsame Eingabe per Hand ist dann nicht mehr nötig. Alle Messdaten werden nicht nur schnell, sondern auch sicher und nach absolut konstanten Kriterien ausgewertet. Auf diese Weise können ganze Bildstapel in kürzester Zeit vollständig automatisiert analysiert werden. Sollte der automatisierte Quantifizierungsprozess an kritischen Punkten einer manuellen Kontrolle bedürfen, so kann in dem jeweiligen Protokoll an beliebiger Stelle ein Anhaltepunkt gesetzt werden. Der automatisierte Prozess wird dann an diesem Punkt unterbrochen und die Einstellungen können überprüft und gegebenenfalls verändert werden. Sind alle Parameter in Ordnung, wird das Protokoll per Mausklick fortgesetzt.
Die Automatisierungen mit LabImage 1D bewirken eine enorme Zeitersparnis und sichern konstante Analysebedingungen. Alle Parameter können individuell angepasst und auf die jeweiligen Bedürfnisse und Anforderungen des Nutzers abgestimmt werden. Diese enorme Flexibilität ist eine Kernressource von LabImage 1D, von denen Nutzer aus den verschiedensten Bereichen der Labordiagnostik profitieren.
